受到叙利亚政府邀请的驻叙俄军，按理说应该与叙利亚政府军关系良好，但是有大量的报道显示，双方的关系很可能并不是那么和谐，驻叙俄军赫梅明基地主要由俄军宪兵保护，俄罗斯国防部不时发布驻叙俄军向叙利亚平民提供人道主义救援物资，或者俄军宪兵与当地儿童玩耍的照片宣传，但却很少出现叙军和俄军的类似场景。
早在俄军介入叙利亚内战前期，大量俄罗斯军官就渗透到叙军营连级担任军事顾问，但此后发生了多次恶性事件，诸如面对极端武装的进攻，叙军抛下俄军军官逃跑，结果导致俄军军官被围后阵亡，这被认为极大的恶化了两军关系，从最近的报道看，驻叙俄军特种部队已经进入了伊德利卜省，主要是负责侦察和引导空地火力，但俄军似乎已经将其在叙政府军里的军事顾问撤出。
在叙利亚阵亡的俄军特种兵装备
最新消息，叙利亚官方电视台报道，云集在哈马前线的叙军和俄军士兵发生内讧，3名俄军士兵被打死，至于叙军伤亡情况不知，根据公开报道看，这是俄军士兵第一次被叙政府军杀死，让人联想起在阿富汗，驻阿美军不是被身边的盟友，阿富汗政府军开枪扫射致死。
关于驻叙俄军和叙军关系不睦的新闻，虽然被俄叙两国官方严密封锁，但依然不时流传出来，由于待遇低下，叙军士兵经常偷窃俄军官兵食品等物品，被偷窃的俄军官兵可不是什么善男信女，每次抓住都是施以斯拉夫老拳，而此前在攻克大马士革附近的耶尔穆克难民营的时候，同样是因为待遇低下，大批叙军士兵抢劫民财，被赶来的俄军宪兵和叙军宪兵武力制服，制服过程中同样不乏拳打脚踢。不是所有的叙军官兵都将俄军视为自己的盟友，认为叙利亚人的事，应该由叙利亚人自己解决，而俄罗斯人传统的大国沙文主义情结，也让俄军官兵与友军之间龌龊不断，居高临下的姿态，让叙利亚人很难跟俄罗斯人做朋友。